DESCRIPCIÓN

Mediante este curso se pretende capacitar a profesionales y/o estudiantes con conocimientos básicos y aplicados sobre las Técnicas de PCR. Se explicarán las bases teóricas y los diferentes pasos a seguir para desarrollar una PCR que incluyen la extracción de ADN y los diferentes pasos de la técnica. Asimismo, se detallarán las diferentes estrategias y soluciones de problemas específicos para obtener un resultado óptimo, que incluyen el diseño de primers empleando programas bioinformáticos, instalaciones/infraestructura y análisis de resultados.

Se explicarán las diferentes aplicaciones en la acuicultura con detección de patógenos en camarón incluyendo: IHHNV, WSSV, YHV, NHP, EMS, empleando PCR en punto final.

Objetivo General

Capacitar a los estudiantes en la técnica de la PCR a través de la aplicación de la biología molecular y desarrollo de la PCR en el laboratorio.

Objetivo Específico

• Comprender las bases moleculares de la PCR.
• Realizar extracción de ADN
• Realizar la PCR y optimizar el proceso
• Elaborar primers empleando programas bioinformáticos.

DIRIGIDO A

• Profesionales y estudiantes relacionados al área de la acuicultura que posean bases de biología

COMPETENCIAS

Al término del curso, los participantes estarán en la capacidad de:

• 1. Comprender el principio de la PCR y su aplicabilidad en la acuicultura.
  2. Conocer las principales enfermedades en camarones
  3. Realizar extracción de ADN y PCR.
  4. Diseñar primers mediante programas bioinformáticos para obtener resultados satisfactorios en la PCR y de acuerdo a protocolos establecidos (OIE).
  5. Analizar resultados de PCR para su optimización.

CONTENIDO (20 horas)

Primera Unidad

Bases Moleculares (4 horas)

• El ADN y el ARN como material hereditario: conceptos básicos.
• Regulación de la expresión génica.
• Genomas.
• Detección e identificación de organismos mediante el análisis del ADN y ARN.
• Extracción de ADN y ARN.
• Determinación de la calidad del ADN.
• Diferenciación entre PCR punto final y tiempo real.
• Técnicas de secuenciación, genómica funcional y estructural.
• Hibridación in situ: uso de sondas nucleicas.
• Manipulación de ácidos nucleicos: ingeniería genética, edición de genoma.

Segunda Unidad

Principales patología virales y bacterianas en camarones (4 horas)

• Principales enfermedades y métodos de diagnóstico
• Virus de la mancha blanca (White spot syndrome virus, WSSV)
• Virus del syndrome de la Cabeza Amarilla (Yellow Head virus, YHV)
• Virus de la necrosis hipodérmica y hematopoiética infecciosa (HHNV)
• Virus del Síndrome de Taura (Taura syndrome virus, TSV)
• Virus de la mionecrosis infecciosa (Infectious myonecrosis virus, IMNV).
• Síndrome de la mortalidad temprana, Early Mortality Syndrome (EMS)
• Necrosis del hepatopáncreas bacteriana (NHP-B).
• Diagnósticos de campo.

Tercera Unidad

Diseño y desarrollo de la PCR (8 horas, práctica)

• Manejo de base de datos en NCBI, blast, diseño de primers con software libre (primer3).
• Análisis filogenético con MEGA.
• Consideraciones en la extracción de ADN para PCR.
• Desarrollo de la mezcla (master mix) de PCR.
• Programa de la PCR en el termociclador.

Cuarta Unidad

Análisis de resultados y optimización (4 horas, práctica)

• Electroforesis en gel de agarosa.
• Revelado del gel
• Análisis de resultados
• Optimización de la PCR
• Ventajas y desventajas de la PCR punto final, PCR tiempo real y secuenciación.
• Interpretación de resultados y solución de problemas.

INSTRUCTORES:

• Sonnya Mendoza Lombana

Acuicultora por la Escuela Superior Politécnica del Litoral

Diplome D`Etudes Approfondies de Physiologie des Invertebres por la Universidad de París

Doctorado en Ciencias Ambientales por la Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Perú

Gerente General NOVAGESTIÓN

Asesora Nacional e Internacional en temas relacionados con la Acuicultura

Docente universitaria

• Ing. Efrén Santos Ordóñez, Ph.D.

Profesor investigador del CIBE-ESPOL. Experto en ingeniera genética y biología molecular. Realiza investigaciones sobre métodos biotecnológicos en mejora genética en banano y plátanos, incluyendo detección de organismos genéticamente modificados y bioseguridad. Asimismo, realiza investigaciones sobre la identificación de genes involucrados a la interacción hospedero-patógeno-medio ambiente, genotipaje, y análisis e identificación de especies vegetales y animales mediante el código de barra molecular. Se especializa en el uso de la PCR para detección y diagnóstico de organismos incluyendo patógenos. Imparte las clases de Genética y Genética de Poblaciones en la Facultad de Ciencias de la Vida y actualmente es Coordinador del Programa Doctoral en Biociencias Aplicadas de la ESPOL.

INFORMES E INSCRIPCIONES:

Dario Siavichay Q.: dec.asesor2@uees.edu.ec

Teléfono Directo: 500 0950 ext.1207

Celular: 098 634 9584